Tuy nhiên, cùng với sự phát triển, TPHCM đang phải đối mặt với rất nhiều thách thức để có thể trở thành một đô thị hiện đại, phát triển bền vững như: thiếu mảng kiến trúc xanh, vấn đề xử lý nước thải, chất thải rắn, năng lượng và an ninh năng lượng…

Đồng tình và đánh giá cao những chiến lược phát triển của TPHCM hướng đến xây dựng thành công mô hình đô thị thông minh, tuy nhiên theo Tiến sĩ Bùi Quốc Bảo - Giảng viên Đại học Tôn Đức Thắng, thành phố cũng cần quan tâm đến việc phát triển bền vững.